Hrvati razvili brzu izradu »proteinskog otiska«

14.12.2007. // Vjesnik // Objavljeno u kategoriji Znanost i tehnologija

Nova metoda mogla bi pridonijeti ranom otkrivanju i karakterizaciji različitih oboljenja kao što su tumori ili zarazne bolesti.Mladi hrvatski biolozi Fran Supek s Instituta »Ruđer Bošković« i Petra Peharec s Prirodoslovno-matematičkog fakulteta u Zagrebu, povezavši metode računalne umjetne inteligencije i eksperimentalne molekularne biologije, uspjeli su razviti novu metodu za brzu i pouzdanu izradu »proteinskog otiska«.
Njihovi rezultati, kako je priopćeno s Instituta, mogli bi pridonijeti razvoju metoda za rano otkrivanje i karakterizaciju različitih oboljenja kao što su tumori ili zarazne bolesti.

Proteini su najvažnija skupina bioloških molekula odgovorna za većinu procesa u stanicama živih organizama. Oni su doslovce »molekularni strojevi« koji omogućuju unos hranjivih tvari u stanicu te izbacivanje štetnih tvari, proizvodnju energije i transport materijala unutar stanice kao i stanično disanje i pokretanje. Zbog njihove iznimne važnosti proteini su jedna od glavnih tema suvremene biologije.
Kod čovjeka je do sada poznato više od pola milijuna različitih proteina, svojstvenih različitim vrstama stanica ljudskog organizma. Različita tkiva, kao što su mišići, kosti, živčano tkivo ili koža, međusobno se razlikuju po jedinstvenom »proteinskom otisku«, odnosno karakterističnom odnosu količina različitih vrsta proteina u stanicama pojedinog tkiva.
Budući da patološke promjene na nekom tkivu redovito uzrokuju i promjenu njegova proteinskog sastava, »proteinski otisak« može poslužiti za rano otkrivanje i karakterizaciju različitih oboljenja, kao što su tumori ili zarazne bolesti.

Izrada kvalitetnog »proteinskog otiska« do sada je bila složen, dugotrajan i skup posao. No, istraživanjem provedenom na uzorcima tkiva popularne začinske biljke hrena, naši su znanstvenici doskočili tom problemu. Koristeći računalne metode umjetne inteligencije, oni su »izvježbali« računalo da iz eksperimentalnih podataka, dobivenih brzim i jednostavnim, ali inače nedovoljno preciznim laboratorijskim postupkom - 1-D elektroforeze - precizno probere najvažnije podatke o »proteinskom otisku« istraživanog uzorka. Time su otvorili vrata razvoju jednostavne, brze, jeftine i pouzdane metode za izradu »proteinskog otiska«.
Ti rezultati bit će objavljeni u siječnju u najuglednijem svjetskom znanstvenom časopisu za područje proteomike Proteomics.
Mladi znanstvenik Fran Supek 19. prosinca održat će predavanje o tom pronalasku u sklopu Salona Matice hrvatske.